尼康工具顯微鏡調(diào)焦的目的是將顯微鏡的物方焦平面調(diào)整到與被測的物平面重合；這時，物體的像將清晰地成在目鏡分劃板上。由于在這之前，已經(jīng)做了目鏡視度調(diào)整，因此，觀察到的像和分劃板同時清晰。
檢查調(diào)焦是否正確的方法很簡單，先移動X、Y坐標使輪廓像與分劃板刻線重合，然后眼睛相對目鏡上下或左右稍微移動，觀察輪廓像相對分劃板刻線是否有相對移動。如果有，則說明二者不在同平面上，存在視差。
調(diào)焦時，眼部肌肉定要放松，盡量不要帶眼鏡，視力的差異用調(diào)節(jié)目鏡視度來彌補。初學(xué)者往往在用只眼觀察時，不自覺地閉上另只眼，這不利于眼部肌肉放松。要養(yǎng)成睜開雙眼的習慣。思想集中在瞄準的那只眼，另只眼的干擾像自然會“視而不見”。
對于安裝在針架上的圓柱體、圓錐體和螺紋類零件，靠直接觀察零件成像清晰度來調(diào)焦，往往不夠，須借助儀器所帶的“定焦桿”來調(diào)焦。
尼康工具顯微鏡光源位置的調(diào)整：
此項調(diào)整，應(yīng)在更換照明發(fā)光器件后進行。其程序為：
1.將塊較薄的白紙放在底光照明聚光鏡上方。
2.打開底光照明開關(guān)，并把亮度旋鈕打到大；儀器的光欄刻度盤也打到大處。
3.調(diào)整燈座外套上的螺釘，使照明亮斑位于聚光鏡中央。
4.松開燈座鎖緊螺釘，推拉燈座，使出光口剛被亮斑充滿，鎖緊螺釘，撤掉白紙，調(diào)低亮度。
尼康工具顯微鏡使用，發(fā)光器件位置可能會走動，應(yīng)經(jīng)常檢查，及時調(diào)整。有些采用LED做發(fā)光器件，亮斑不能調(diào)整，只須調(diào)整亮斑大小。
